浙江省衢州市疾病預防控制中心是在原浙江省衢州市衛生防疫站體制改革的基礎上組建而成的，成立于2001年11月，是由市衛生局舉辦的全額撥款公益性事業單位。集疾病預防與控制、衛生監測與評價、健康教育與促進、應用研究與指導、技術管理與服務為一體的公益性事業單位，承擔全市傳染病、地方病、寄生蟲病、慢性非傳染性疾病、職業病、食源性疾病、學生常見病、傷害等疾病的預防與控制、應急預警與處置，也為衛生監督執法提供強大的技術支撐，是全市疾病預防控制工作的業務技術指導中心。中心地處衢州市區西安路與環城東路交匯處，占地面積3.61畝，建筑面積5371平方米，地理位置優越，交通便利。中心現有職工62人，平均年齡35歲，其中研究生7人，大學本科35人，大中專學歷16人；高級職稱12人，中級職稱25人。中心設有9個業務科室和2個職能科室。建有國家生物安全二級實驗室、PCR實驗室、艾滋病確證實驗室等；擁有氣相色譜-質譜聯用儀、熒光定量PCR儀、氣相色譜儀、液相色譜儀、原子吸收分光光度計、離子色譜儀等精密儀器設備，是通過計量認證的衛生檢測檢驗機構。
